Het onderzoekstraject in het COS start na de wachttijd met een intakegesprek met de ouders. Daarna bekijkt een multidisciplinair team welke onderzoeken nodig zijn en stelt het indien nodig een diagnose.
Verder is het COS erkend binnen het Referentiecentrum voor Autismespectrumstoornissen. Daarnaast maakt het COS deel uit van het follow-up centrum in Antwerpen voor prematuurtjes.